Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms