Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CntrobQ8CB62 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntrobQ8CB62 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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