Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BP99 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Q8BP99 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BP99 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BP99 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BP99 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BP99 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Q8BP99 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BP99 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BP99 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BP99 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BP99 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BP99 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BP99 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BP99 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BP99 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BP99 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Q8BP99 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BP99 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Q8BP99 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Q8BP99 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BP99 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BP99 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Q8BP99 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Q8BP99 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Q8BP99 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Q8BP99 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BP99 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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