Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

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Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms