Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms