Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms