Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms