Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms