Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms