Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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