Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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