Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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KRTAP21-3Q3LHN1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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KRTAP21-3Q3LHN1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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