Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UVSSAQ2YD98 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms