Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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