Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PrkcqQ02111 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PrkcqQ02111 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PrkcqQ02111 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PrkcqQ02111 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PrkcqQ02111 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PrkcqQ02111 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PrkcqQ02111 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PrkcqQ02111 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PrkcqQ02111 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PrkcqQ02111 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PrkcqQ02111 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PrkcqQ02111 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PrkcqQ02111 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PrkcqQ02111 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PrkcqQ02111 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcqQ02111 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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