Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gfra1P97785 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gfra1P97785 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gfra1P97785 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gfra1P97785 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gfra1P97785 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gfra1P97785 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gfra1P97785 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gfra1P97785 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gfra1P97785 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gfra1P97785 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gfra1P97785 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gfra1P97785 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms