Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Irx1P81068 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Irx1P81068 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Irx1P81068 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Irx1P81068 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Irx1P81068 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Irx1P81068 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Irx1P81068 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irx1P81068 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms