Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms