Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ActbP60710 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ActbP60710 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ActbP60710 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ActbP60710 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ActbP60710 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms