Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SmoP56726 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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SmoP56726 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmoP56726 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmoP56726 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmoP56726 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmoP56726 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmoP56726 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmoP56726 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmoP56726 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmoP56726 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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