Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrlP54846 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrlP54846 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms