Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClgnP52194 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms