Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc4P51655 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc4P51655 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms