Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CitP49025 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CitP49025 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CitP49025 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms