Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rab11bP46638 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rab11bP46638 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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