Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf5P43027 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf5P43027 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf5P43027 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf5P43027 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf5P43027 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf5P43027 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gdf5P43027 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf5P43027 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf5P43027 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf5P43027 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf5P43027 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf5P43027 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf5P43027 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms