Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a2P43006 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms