Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms