Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms