Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms