Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmga1P17095 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms