Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRFP10586 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRFP10586 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRFP10586 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRFP10586 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRFP10586 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms