Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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