Protein–RNA interactions for Protein: O08586

Pten, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtenO08586 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtenO08586 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtenO08586 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtenO08586 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtenO08586 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtenO08586 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtenO08586 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtenO08586 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtenO08586 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtenO08586 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtenO08586 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtenO08586 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtenO08586 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtenO08586 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtenO08586 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtenO08586 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtenO08586 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtenO08586 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtenO08586 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms