Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
7530416G11RikJ3QJX6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms