Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms