Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pate1E9Q658 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pate1E9Q658 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pate1E9Q658 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pate1E9Q658 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pate1E9Q658 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pate1E9Q658 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pate1E9Q658 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pate1E9Q658 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pate1E9Q658 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Pate1E9Q658 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Pate1E9Q658 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate1E9Q658 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate1E9Q658 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Pate1E9Q658 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate1E9Q658 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Pate1E9Q658 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Pate1E9Q658 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate1E9Q658 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate1E9Q658 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate1E9Q658 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate1E9Q658 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate1E9Q658 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate1E9Q658 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Pate1E9Q658 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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