Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms