Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms