Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms