Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms