Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
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