Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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