Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms