Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ72

Rprm, Protein reprimo, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmQ9JJ72 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RprmQ9JJ72 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RprmQ9JJ72 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms