Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms