Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms