Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms