Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms