Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PclafQ9CQX4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PclafQ9CQX4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PclafQ9CQX4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PclafQ9CQX4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PclafQ9CQX4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PclafQ9CQX4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms